Ήταν τέτοιες μέρες το 2020 όταν με απόφαση του Κυριάκου Μητσοτάκη, η ΝΔ διέγραψε από την κοινοβουλευτική ομάδα της στην Ευρωβουλή τον Θοδωρή Ζαγοράκη. Είχε προηγηθεί η έντονη αντίδρασή του και η δήλωσή του για παραίτηση.
Όλα συνέβησαν αμέσως μετά την εισήγηση-βόμβα της ΕΕΑ για αποβολή από το πρωτάθλημα ΠΑΟΚ και Ξάνθης, με τον ευρωβουλευτή Θοδωρή Ζαγοράκη να ξεκαθαρίζει ότι σε περίπτωση μη δικαίωσης του Δικεφάλου του Βορρά θα παραιτηθεί από τη θέση του και κατ’ επέκταση από τη ΝΔ. «Εάν αυτό δεν γίνει, εάν ο ΠΑΟΚ δεν δικαιωθεί, εγώ δεν μπορώ να συνευρίσκομαι στην ίδια πολιτική στέγη με όλους αυτούς που βάλλουν καθ΄ υπόδειξη τρίτων εναντίον του ΠΑΟΚ και του ίδιου του ελληνικού ποδοσφαίρου».
Ένα χρόνο μετά, πάλι με απόφαση Μητσοτάκη, ο Θεόδωρος Ζαγοράκης επανεντάσσεται στην ευρωκοινοβουλευτική ομάδα της Νέας Δημοκρατίας. Είχε προηγηθεί μάλιστα και συνάντηση του Πρωθυπουργού με τον ευρωβουλευτή στο Μαξίμου, μα παρόντα και τον Υφυπουργό Αθλητισμού, Λευτέρη Αυγενάκη.
Από την πλευρά του ο Θοδωρής Ζαγοράκης ενημέρωσε το Μαξίμου ότι προτίθεται να διεκδικήσει την ηγεσία της μεγαλύτερης αθλητικής ομοσπονδίας της χώρας, της ΕΠΟ, προκειμένου να υπηρετήσει από άλλη θέση το ελληνικό ποδόσφαιρο και να εφαρμόσει το νέο ολιστικό σχέδιο για τη θεσμική αναμόρφωσή του.