Ο Μακεδονικός είναι ένα δημιούργημα οραματιστών βιοπαλαιστών της προσφυγικής Θεσσαλονίκης, όπως αναφέρει η εφημερίδα «Θεσσαλονίκη». Το 1928 με την αρχική ονομασία «Προσφυγική Ένωση Θεσσαλονίκης» μπήκε δυναμικά στο χώρο του αθλητισμού, αλλά το 1936 αποτελεί χρονιά σταθμός για το σύλλογο που μετονομάζεται σε «Μακεδονικός», υιοθετώντας το όνομα της ομάδας που δύο χρόνια πριν είχε διαλυθεί. Το όνομα αυτό το επέλεξαν οι ιδρυτές του συλλόγου για αθλητικούς, αλλά και εθνικούς λόγους, αφού ήθελαν να περάσουν το μήνυμα ότι η Μακεδονία είναι Ελλάδα και ο σύλλογος αυτός είναι… Μακεδονικός.
Ο Β’ Παγκόσμιος Πόλεμος και η γερμανική κατοχή οδηγούν σε παύση κάθε αθλητικής δραστηριότητας για τα επόμενα χρόνια και το καλοκαίρι του 1945 ξεκινάει την προσπάθεια οργάνωσης του συλλόγου σε όλα τα επίπεδα με την συγχώνευση της ομάδας με τον Ολυμπιακό Τερψιθέας και την απορρόφηση στους κόλπους του συλλόγου νεαρών ικανότατων παικτών, οι οποίοι κυριολεκτικά τον απογειώνουν.
Το έτος 1968, αποφασίζεται η μετονομασία σε «Μακεδονικός Θεσσαλονίκης», ενώ το 1974, για οικονομικούς λόγους, ο Μακεδονικός συγχωνεύεται και με τον ΑΠΟ Νεάπολης Θεσσαλονίκης (στη Νεάπολη είχε ο σύλλογος αρκετά ισχυρή βάση υποστηρικτών) και μετονομάζεται σε Α.Π.Σ. Μακεδονικός Νεαπόλεως, ενώ του παραχωρείται και η θρυλική «παράγκα» για τα γραφεία του συλλόγου, αλλά από τότε, άλλαξαν πολλά.
Ο Μακεδονικός, σήμερα, υπό την διοίκηση του κ. Παύλου Ανδρώνη, έχει αναπτύξει μια έντονη δραστηριότητα σε πολλά αθλήματα και η ποδοσφαιρική ομάδα, που αποτελεί την «ναυαρχίδα» του συλλόγου, βρίσκεται στην Superleague 2, κερδίζοντας μάλιστα για δεύτερη συνεχόμενη χρονιά, με άνεση, την είσοδό της στα πλέι οφ του πρωταθλήματος και παίζοντας ρόλο ρυθμιστή.
Παράλληλα, ο Μακεδονικός κάνει πολύ καλή δουλειά και στις ακαδημίες, όπου καθημερινά γυμνάζονται εκατοντάδες παιδιά και διατηρεί τμήματα από τις πιο μικρές ηλικίες έως και την Κ19, πριν την πρώτη επαγγελματική ομάδα, προωθώντας παιδιά από την Ακαδημία του, σε αυτήν.
Δεν είναι όμως το ποδόσφαιρο το μοναδικό άθλημα στον σύλλογο, ο οποίος διαθέτει τμήματα μπάσκετ, βόλεϊ, κολύμβησης και τένις, αλλά το πιο σημαντικό είναι ότι το όνομα του συλλόγου «Μακεδονικός», παραμένει εμβληματικό και απόλυτα συνδεδεμένο με την περιοχή της Μακεδονίας και της Βόρειας Ελλάδας.
Πρόκειται για μια «αθλητική κυψέλη» στην δυτική Θεσσαλονίκη, που συγκεντρώνει πολλά παιδιά και το μέλλον ανήκει στον Μακεδονικό, με τον πρόεδρό του, Παύλο Ανδρώνη, να έχει στελεχώσει όλα τα τμήματα με άξιους συνεργάτες, προπονητές και υπευθύνους τμημάτων, οι οποίοι συγκεντρώνουν στις αθλητικές εγκαταστάσεις του συλλόγου, καθημερινά, πάρα πολλά παιδιά, τα οποία φοράνε την πράσινη φανέλα, μοιράζοντας υποσχέσεις ότι θα είναι οι αυριανοί άσοι και πρωταθλητές του ελληνικού αθλητισμού!